Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms