Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGO1Q5FBB7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SGO1Q5FBB7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGO1Q5FBB7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGO1Q5FBB7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGO1Q5FBB7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGO1Q5FBB7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGO1Q5FBB7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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