Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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