Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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