Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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