Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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