Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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