Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FRMPD4Q14CM0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMPD4Q14CM0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms