Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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