Protein–RNA interactions for Protein: Q13952

NFYC, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYCQ13952 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NFYCQ13952 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NFYCQ13952 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms