Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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MTMR3Q13615 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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