Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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NAE1Q13564 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NAE1Q13564 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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