Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD4Q13485 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD4Q13485 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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