Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms