Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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STRN3Q13033 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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