Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms