Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNDQ07001 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms