Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms