Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms