Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms