Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms