Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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