Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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