Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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