Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms