Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms