Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms