Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUFMP49411 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUFMP49411 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUFMP49411 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms