Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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CXCL5P42830 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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CXCL5P42830 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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CXCL5P42830 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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CXCL5P42830 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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CXCL5P42830 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CXCL5P42830 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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CXCL5P42830 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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CXCL5P42830 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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