Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms