Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP1P29466 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms