Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms