Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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