Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms