Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms