Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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