Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms