Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms