Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF35P13682 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF35P13682 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms