Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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