Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP2C9P11712 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms