Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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