Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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TMEM225BP0DP42 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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TMEM225BP0DP42 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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