Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRCP08575 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRCP08575 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRCP08575 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRCP08575 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRCP08575 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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