Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPBP07199 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPBP07199 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBP07199 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms