Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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