Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms