Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms