Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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