Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUSKO15146 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUSKO15146 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms